多序列比对工具clustalx下载安装

如何序列对比？ClustalX(序列对比软件)轻松帮助用户。用于多重比对不同物种的序列，以确定该序列与其它序列间的同源性大小，适用于对核酸与蛋白序列进行多序列比对。是生物学上用来研究分子序列的应用程序，在对核酸与蛋白序列进行多序列比对时就要用到它

clustalx下载安装图一

1、下载解压文件，找到clustalx.msi双击安装

2、选择安装位置C:Program Files (x86)clustalclustalx

3、准备安装，点击install进入安装

4、安装完成

clustalx下载安装图二

A、B、C三条序列比对。其实就是：A和B比；A和C比；B和C比

同理n条多序列比对就是做nC2次两序列比对，因此多序列比对的本质就是多次两条序列比对，也就是某条序列和其余的各个序列都进行一次比对.那么参数的设置当然就是设置两条序列比对时的规则就可以了.

Clustalx的多序列比对算法是基于双序列比对的，它先将所有序列两两比对，然后根据两两比对结果构建指导树，再根据指导树依次添加相似度最高的序列，直至全部序列都被加入.所以对双序列比对参数的设置是Clustalx进行多序列比对所必需的~

clustalx下载安装图三

1，从网上看来说CLUSTALX软件使用的时候，开始要输入FASTA格式准备的DNA序列test.seq文件。请问这种文件怎么生成啊?记事本?

其实没有规定的文件名，不一定是叫test.seq，任何你想要的都可以，除了中文名（下面会说明）。主要里面的内容是正确的格式就行了~。Clustal支持的格式有多种，如NBRF/PIR，EMBL/SWISSPROT，Pearson (Fasta)，Clustal (*.aln)，GCG/MSF (Pileup)，GCG9/RSF and GDE等

2，什么使用ClustalX时，总是导入不了序列，出现 ERROR:Can not open output file??

这个问题挺多人碰到过的~这是因为你导入的文件的路径包含有中文名。把文件放在其它地方看看。最好路径也不要有空格了。当然前提是你的格式要正确了。这个问题同样适用于ClustalW或其它dos类的软件

3，ClustalX比对后的结果中.aln文件是什么？

这个是序列比对结果的文件。关于这部分，你可以看如何把clusterX的结果转为漂亮的图片

4，ClustalX比对后的结果中.dnd文件是什么？

这个文件是系统进化树文件，需要装TreeView软件才能看（用Dnaman也可以的），进化树显示工具TreeView的下载